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基于流式細胞術的單細胞技術發現新型樹突狀細胞亞群

發布時間:2019-11-14 來源:未知 瀏覽: 關鍵詞: 樹突狀細胞亞群
樹突狀細胞(DC)是抗原遞呈細胞,未成熟細胞具有較強的遷移能力,成熟細胞能有效激活初始T細胞。根據其功能,DC可分為cdc1和cdc2兩個亞組,cdc1細胞表面表達XCR1、CD8α、clec9a或CD103,其分化依賴于IRF8和batf3。cdc1具有遞呈抗原和促進CD8+T細胞的功能。cdc2s表面表達CD11b、cd172α、Sam、cd301b或Clec12A,分化依賴于IRF4和notch,但對cdc2s功能異質性的研究尚不深入。
在最近的細胞雜志上,發表了一篇題為“小鼠和人類樹突細胞異質性的傳統基礎”的文章。通過單細胞測序、轉錄組分析和染色質分析,發現了新的樹突狀細胞亞型。發現cdc2s有兩個不同的亞群,具有不同的分化和轉錄調控模式,以及不同的代謝特性和功能。
 
本研究將cdc2s定義為cdc2a和cdc2b的兩個細胞亞群,發現cdc2a具有抗炎反應,cdc2b具有促炎反應。結果發現,這兩個亞群表達不同的趨化因子及其受體。Cdc2b特異性表達cxcl2、CCL6和ccl9,cdc2a表達CCL3、CCl4和CCL5。CD2a可以表達MMP9和areg。Cdc2b表達IL-1α和IL-27。靜息狀態下,兩組細胞均表達MHCⅡ、共刺激分子和PD-L1。當CpG刺激時,cdc2a表達較少的促炎因子。在LPS刺激下,cdc2b中MHCⅡ和共刺激分子的表達較高。結果表明,cdc2b分泌的TNF-α和IL-6細胞因子高于cdc2a,cdc2a促進T細胞向IFN-γ和IL-17at細胞分化的能力較弱。
 
本文不僅發現了新的DC亞群,而且在技術方法上也不同于傳統的第二代RNA-SEQ測序。基于流式細胞術,分離后細胞的RNA-SEQ序列是單細胞序列“譜系”的一半。本研究充分利用流式細胞術分析細胞表面和細胞內分子表達特征的優勢,定義不同類型的細胞群,測定分離亞類的純度,分析細胞的大小和總量,分析單個細胞的多項參數。
 
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關鍵詞: 樹突狀細胞亞群

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